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| Registros recuperados: 15 | |
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| Gourmelon, Michele; Caprais, Marie-paule; Le Mennec, Cecile; Mieszkin, Sophie; Ponthoreau, C.; Gendronneau, M.. |
| Faecal contamination sources were identified in coastal areas around the Guerande-Atlantique peninsula using two microbial source tracking (MST) methods: (i) Bacteroidales host-specific 16S rRNA gene markers measured by real-time PCR and (ii) F-specific bacteriophage (FRNAPH) genotyping. Both methods were used on 63 water samples from 7 water courses. HF183 marker and bacteriophage genogroup II (FRNAPH II) were detected in all water samples and in the majority of water samples, respectively, from La Torre stream (W5), Piriac (W2), R2000 (W3) and Mazy (W7) rain water drains, and also detected, less frequently, in Le Nau drain (W4), suggesting contamination by human faecal sources at these sites. These human markers were weakly detected in Pouliguen channel... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Bacteroidales; F-specific RNA bacteriophages; Faecal bacterial indicators; Microbial source tracking; Water. |
| Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00003/11384/10304.pdf |
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| Pommepuy, Monique; Caprais, Marie-paule; Le Mennec, Cecile; Parnaudeau, Sylvain; Le Guyader, Francoise; Camus, Patrick; Dimeet, Joel; Treguier, Cathy; Bon, Fabienne; Pothier, Pierre; Kohli E, Evelyne; Brachet, R.; Flahault, A.; Sarrette, B.; Vilagines, P.. |
| Le développement des activités humaines dans les régions littorales entraîne le rejet de germes pathogènes d'origine fécale dans l'environnement estuarien et marin. L'amélioration des traitements d'épuration, mais aussi la mise en place de normes bactériologiques pour surveiller les zones de production conchylicole, ont entraîné une diminution des épidémies liées à la consommation de coquillages. Ainsi, à l'heure actuelle, même si l'origine de ces gastro-entérites n'est pas élucidée dans sa globalité (rôle probable des vibrios ou d'autres bactéries), les virus semblent jouer un rôle important et leur implication té clairement établie dans les phénomènes épidémiques (Miossec et Vaillant, 2001) Les principaux virus humains susceptibles d'être détectés dans... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2002 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15549/12936.pdf |
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| Le Saux, Jean-claude; Pommepuy, Monique; Caprais, Marie-paule; Le Mennec, Cecile; Parnaudeau, Sylvain; Le Guyader, Francoise. |
| Un des objectifs de ce projet est d'assurer un développement économique durable à l'ostréiculture, basé sur des technologies propres à définir des produits adaptés à la sécurité alimentaire. La production conchylicole est importante sur le marché européen et représente plus d'un tiers du marché mondial, soit plus de 775 000 tonnes/an, dont plus de 140 000 tonnes d'huîtres produites par la France. En Europe, le marché des coquillages représente plus de 456 M d'euros/an produits par 8 500 entreprises employant environ 40 000 personnes. Les huîtres à elles seules, représentent plus de 140 Md' euros/an. Le développement durable de cette activité passe par la maîtrise de la qualité du produit et en particulier de sa qualité sanitaire. En fait, le libre échange... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2003 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15545/12931.pdf |
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| Gourmelon, Michele; Caprais, Marie-paule; Segura, Raphael; Le Mennec, Cecile; Lozach, Solen; Piriou, Jean-yves; Rince, A. |
| In order to identify the origin of the fecal contamination observed in French estuaries, two library-independent microbial source tracking (MST) methods were selected: (i) Bacteroidales host-specific 16S rRNA gene markers and (ii) F-specific RNA bacteriophage genotyping. The specificity of the Bacteroidales markers was evaluated on human and animal (bovine, pig, sheep, and bird) feces. Two human-specific markers (HF183 and HF134), one ruminant-specific marker (CF193'), and one pig-specific marker (PF163) showed a high level of specificity (>90%). However, the data suggest that the proposed ruminant-specific CF128 marker would be better described as an animal marker, as it was observed in all bovine and sheep feces and 96% of pig feces. F RNA... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-3535.pdf |
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| Pommepuy, Monique; Caprais, Marie-paule; Le Saux, Jean-claude; Le Mennec, Cecile; Parnaudeau, Sylvain; Madec, Yvon; Monier, Martial; Brest, Goulven; Le Guyader, Francoise. |
| Depuration processes try to eliminate microorganisms using seawater to allow living, filter-feeding shellfish to naturally purge themselves from agents they accumulated from the environment. Until now the only parameter to evaluate depuration was the decrease in E. coli counts. Studies have shown that viruses can persist in the environment longer than E. coli and that shellfish meeting the endstandard (< 230 E.colil /100g) have been involved in viral outbreaks. Starting in February 2000, the European Commission has been funding (Fifth Framework Programme), a 3-year project entitled "Virus Safe Seafood". One of the specific objectives of this project is to innovate technology for shellfish depuration. For this purpose a depuration system was designed and... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Bacteriophage FRNA; Depuration; Shellfish. |
| Ano: 2002 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2002/acte-1208.pdf |
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| Mieszkin, Sophie; Caprais, Marie-paule; Le Mennec, Cecile; Le Goff, Manon; Edge, T. A.; Gourmelon, Michele. |
| Aims: The aim of this study was to identify the origin of faecal pollution impacting the Elorn estuary (Brittany, France) by applying microbial source tracking (MST) markers in both oysters and estuarine waters. Methods and Results: The MST markers used were as follows: (i) human-, ruminant- and pig-associated Bacteroidales markers by real-time PCR and (ii) human genogroup II and animal genogroup I of F-specific RNA bacteriophages (FRNAPH) by culture/genotyping and by direct real-time reverse-transcriptase PCR. The higher occurrence of the human genogroup II of F-specific RNA bacteriophages using a culture/genotyping method, and human-associated Bacteroidales marker by real-time PCR, allowed the identification of human faecal contamination as the... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Escherichia coli; Estuarine and river waters; F-specific RNA bacteriophages; Host-associated Bacteroidales markers; Microbial source tracking; Shellfish. |
| Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00153/26426/25250.pdf |
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| Monfort, Patrick; Hervio Heath, Dominique; Caprais, Marie-paule; Pommepuy, Monique; Annezo, Jean-pierre; Loaec, Solen; Le Mennec, Cecile; Guillerm, Emmanuelle; Boulben, Sylviane; Bilien, Gwenael; Bonsor, Robert; Porter, Jonathan; Pickup, Roger. |
| Le projet européen Cycleau, initié à l'échelle locale sur la problèmatique de l'envasement et de l'ensablement de l'estuaire du Bélon, y a également intégré un volet bactériologique en raison des contraintes fortes que faisaient peser les pics conjoncturels de contamination sur la profession conchylicole (fermetures temporaires, déclassement éventuel) mais plus largement sur l'image du territoire (impact touristique) et en définitive sur son développement durable. Pour satisfaire la restauration de la qualité des eaux estuariennes, l'IFREMER a fait appel à un certain nombre d'outils susceptibles de contribuer à la formulation d'un diagnostic pertinent et ainsi de répondre aux préoccupations des acteurs du littoral. Pour ce faire, nous avons créé un réseau... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Bassin versant; Contamination fécale; Escherichia coli; Flux bactériens; Bactériophages; SIG; Évaluation. |
| Ano: 2006 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31077/29490.pdf |
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| Caprais, Marie-paule; Le Mennec, Cecile; Pommepuy, Monique; Le Saux, Jean-claude; Gourmelon, Michele. |
| In Europe, shellfish harvesting areas are classified according European Directive EC N°854/2004, using classic faecal indicator levels (Escherichia coli). A better indicator is needed, however, because shellfish may contain other human pathogens. Other indicator organisms have therefore been evaluated and, among these, coliphages meet most of the requirements to serve as indicators and models for enteroviruses. In order to evaluate the capacity of coliphages as indicators, a total of 764 shellfish were sampled in 2004 from 70 shellfish harvesting areas monitored by the Ifremer microbiological surveillance network (REMI, http://www.ifremer.fr/envlit/), and tested for F-specific RNA bacteriophages (FRNAPH). Two species of bivalve mollusc were collected... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: F-specific RNA bacteriophage; Shellfish; Faecal pollution; Discrimination. |
| Ano: 2009 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17749/15271.pdf |
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| Cantet, Franck; Hervio-heath, Dominique; Caro, A; Le Mennec, Cecile; Monteil, Caroline; Quemere, Catherine; Jolivet-gougeon, Anne; Colwell, Rita R.; Monfort, Patrick. |
| Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio cholerae are human pathogens. Little is known about these Vibrio spp. in the coastal lagoons of France. The purpose of this study was to investigate their incidence in water, shellfish and sediment of three French Mediterranean coastal lagoons using the most probable number-polymerase chain reaction (MPN-PCR). In summer, the total number of V. parahaemolyticus in water, sediment, mussels and clams collected from the three lagoons varied from 1 to >1.1 x 10.3 MPN/l, 0.09 to 1.1 x 10.3 MPN/ml, 9 to 210 MPN/g and 1.5 to 2.1 MPN/g, respectively. In winter, all samples except mussels contained V. parahaemolyticus, but at very low concentrations. Pathogenic (tdh- or trh2-positive) V. parahaemolyticus were... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Vibrio; Lagoons; Shellfish; Water; Sediment; Human pathogen. |
| Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00148/25890/23889.pdf |
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| Desdouits, Marion; Garry, Pascal; Gourmelon, Michele; Hervio Heath, Dominique; Hubert, Francoise; Kaelin, Gaelle; Kergaravat, Cedric; Le Mennec, Cecile; Le Guyader, Soizick; Loiseau, Veronique; Lozach, Solen; Maillot, Jessica; Ollivier, Joanna; Parnaudeau, Sylvain; Piquet, Jean-come; Quenot, Emmanuelle; Rocq, Sophie; Schaeffer, Julien; Serghine, Joelle; Vallade, Emilie; Veron, Antoine; Wacrenier, Candice. |
| Ce rapport présente une synthèse des actions, et travaux réalisés par le laboratoire Santé Environnement et Microbiologie pendant l’année 2018. Les divers projets de recherche sont résumés et les derniers développements ou résultats sont brièvement évoqués. Les actions en tant que Laboratoire National de Référence pour la Microbiologie des Coquillages et les activités pour la coordination du réseau REMI sont également présentées. |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Microbiologie sanitaire; Bactéries entériques; Vibrions; Virus entériques humains; Norovirus; Coquillage; Activité de référence; REMI.. |
| Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00491/60218/63584.pdf |
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| Gourmelon, Michele; Montet, Mp; Loaec, Solen; Le Mennec, Cecile; Pommepuy, Monique; Vernoy-rozand, C. |
| La qualité sanitaire du milieu marin côtier est influencée par la présence de rejets urbains ou de rejets diffus d'origine agricole. Ces effluents sont riches en bactéries ou virus d'origine fécale, dont certains ont été mis en cause dans des pathologies humaines (Beeching, 1997 ; Feldhusen, 2000 ; Lipp et Rose, 1997 ; Yam et al., 1999). Parmi les microorganismes pouvant présenter un danger pour l'homme, certains, pathogènes émergents ces dernières années, n'ont été que récemment recherchés dans l'environnement : on peut citer les Cryptosporidium et les Giardia pour les parasites, les norovirus pour les virus et les Escherichia coli vérotoxiques (VTEC) pour les bactéries. Ces derniers ne sont connus que depuis 1982, date à laquelle E. coli 0157 : H7 a été... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2003 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00106/21697/19276.pdf |
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| Parnaudeau, Sylvain; Le Mennec, Cecile; Miura, Takayuki; Le Saux, Jean-claude; Le Guyader, Soizick. |
| Human enteric viruses discharged in raw sewage are hightly resistant and may be detected in surface waters, coastal areas and shellfish. Whereas noroviruses, responsible for relatively benign acute gastroentritis, are the most common agents implicated in shellfish borne outbreaks, other human viruses which cause severe human diseases, such as hepatitis A virus, may also be transmitted. Environmental studies have demonstrated that virus concentrations detected in shellfish are higher than in surrounding waters. This concentration may explain the high prevalence of noroviruses detected in various shellfish species collected in different countries. If many questions remain regarding viral contamination of shellfish, the most important seems to be the... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Shellfish; Human enteric viruses; Norovirus; Hepatitis A virus; Coquillage; Virus entérique humain; Norovirus; Virus de l'hépatite A. |
| Ano: 2014 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00317/42849/42258.pdf |
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| Registros recuperados: 15 | |
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